沈阳药科大学高等职业技术学院是药科大学的二级学院。学院位于铁西区北一西路，占地面积为2.4万平方米，建筑面积1.7万平方米。学院现有教职工人数169人。其中专任教师73人；教授、副教授33人，占教师总数45%；中级职称及以下40人。研究生17人，硕士在读19人，博士在读3人。教辅14人，图书情报人员10人，辅导员教师10人。其余为行政管理人员及工人。
学院分为药学系、医疗器械系、基础部二系一部和一个实训教学中心。设有8个专业：医用电子仪器与维护、医疗器械制造与维护、药物制剂技术、药物分析与检验、药品经营与管理、制药设备维修技术、中药制药技术、中药应用技术。有13个教研室。有多媒体教室12个，座位数达到1500个座位。学院现在实验、实训室36个。其中实验室13个，实训室23个。学院在实验、实训基地建设中，几年来加大资金投入，已达600多万元，其中中央财政支持80万元。实训设备如下： 医疗器械有：CT机、X光机、脑电图机、心电图机、心电监护仪、肌电图机、牙科机、呼吸机、麻醉机、吸痰器、计算机接口设备、生化分析仪、尿便分析仪、血液分析仪及电子电工仪器设备。 制药设备有：压片机、胶囊机、铝塑包装机、颗粒包装机、滴丸机、泡腾制粒机、薄膜包衣机、粉针压盖机、蜜丸机、润药机、蒸药机、切药机、煅药机、炙药机、炒药机、中药提取设备、反渗透制水设备、注射剂洗瓶机、分装机、粉针分装机，粉碎机、洗安瓶机等大型生产设备。
仪器分析仪器有：高压液相分析仪8台、气相色谱分析仪4台、紫外分光光度计8台。 模拟药店1个，中药标本室1个。 计算机室有计算机120台。 学院目前已能开展的实训课程内容如下： 固体制剂：片剂、胶囊、散剂、颗粒剂、薄膜包衣、泡腾制粒、粉针剂的分装、压盖。 液体制剂：注射用水制备、各种规格水针剂。 中药制剂：蜜丸、水丸、中药成分提取、中药饮片、滴丸剂。 中药栽培：在药草园中进行栽种、田间管理、采收教学。 中药饮片加工：能生产各种饮片及中药炮制。 药物分析：能按中国药典进行药物化学分析。 仪器分析：能按中国药典进行药物仪器分析。现在学院已经启动新一轮教学改革。全院专业课程按生产流程和生产岗位群设置课程，以达到培养有实践动手能力人才的目的。目前已有省级精品课1门，校级精品课3门，其中今年将申报省级精品课2门。校级教学名师1人。院级精品课4门。申报校级教学团队2个。 省级“十一五”教改课题三项，校级科研课题17项，课程改革课题20项。通过轰轰烈烈的课程改革和教学改革研究，推动了学院教学从传统的学科式教学向高等职业以生产过程设课的课程改革。 目前学院根据职业教育特点进行课改后，已编写校本教材30本，参加化工出版社、人民卫生出版社、中国医药科技出版社编写的教材26本。参加教师26人次。沈阳药科大学高职学院，在招生与就业方面具有显著的优势。因校园面积条件限制，近三年每年分配招生指标为700人，现在校生1806人。学生报名上线名额均在招生指标的1~2倍，但由于条件所限，招生人数少，许多考生无缘被录取。 就业率是省内最好的职业院校之一。该院制药、药物分析、制药设备、药品营销专业，以去年底双选会为例，学生一次性签约就达90%，今年继续推介，可达95%以上。企业来校招收16—40人的单位就有16个。由于企业对学院学生动手能力的认可，今年有两个单位与学院签订了三年定单式培养协议，每年招生105人的计划，使学生入学就就业，学生受到企业欢迎，学院受到家长的欢迎，目前来院的8家企业招收学生的推介会，已出现学生供不应求的局面。2009年毕业生有多家企业已经预约。医疗器械全国目前只有2—3个高职院校有此专业，全国市级以上医院、器械公司有数千个，专业特色鲜明，分配也是非常抢手。福建医疗器械企业今年也与学院签订了定单式培养每年30人。 学院学生就业质量也很高。企业除承诺给学生上三险一金外，月工资已达1000-2000元之间，个别学生工作业绩突出，工资已达3000元，且另有奖金。 学生的基本业务素质较高。学生英语A、B级通过率达95%以上，几年来有300余人通过了大学英语四、六级。计算机二级通过率达到55%以上。学院实行双证制度以后，连续三年学生取得劳动厅的中、高级职业资格证书达130%，其中有30%多学生同时拿到中、高级两个职业资格证书。 学院虽然是专科层次，但学生几年来招生录取分数均在400--500分以上。毕业的学生连续三年专科升本科每年都在57人左右。第二届专升本科班毕业学生30人中有14人参加研究生考试并超过研究生录取分数线。2008年有一人直接考上研究生。 学院专业性强。主要以医药生产、销售、管理为培养目标，掌握医药生产技术、中药栽培和饮片加工技术、药物分析技术、中药提取和中药制剂技术、药品养护和销售，培养的学生主要面向医药企业大生产和销售。目前在省内具有这方面专业人才培养办学条件和实力的只有沈阳药科大学高职学院，而且学院在全国高等医药职业院校中也占有重要地位。也是全国职业教育学会中，医药分会副理事单位。 医疗器械是全国仅有的三个有此专业的学校之一。专业历史较久，教师的生产和维修能力在社会上有相当的影响力，他们也具备面向社会医疗设备的维修能力，有的教师担任国外西门子公司等在国内企业的技术顾问。这个学院是很有发展前途的学院。设有中央电大"药学"专科、“卫生事业管理”、“机械制造及其自动化”本科远程教育工作站；吉林大学"生物制药"、“药物制剂”专业本、专科自考辅导站；辽宁省“药学”自考本科工作站；沈阳市劳动和社会保障局（十三个工种）职业资格技能鉴定所。 学院坚持"团结、勤奋、求实、创新"的校训精神，以加快我国医药、医疗器械的发展为己任，以建设特色鲜明的高职院为目标，与时俱进，开拓创新，立足辽宁、服务全国，为培养更多的高技能人才而努力奋斗。
