稍有经验的养殖户都知道，乌鸡在产蛋后孵化前的种蛋都要进行消毒，这个步骤对于繁殖流程来说非常重要!原因是消毒可以减少雏鸡患病的几率。
刚从母乌鸡体内产出种蛋的蛋壳上可能含有细菌，当蛋产到塑料垫上时容易被污染。刚产出的蛋温度较高，若不及时收集则导致细菌在蛋壳上繁殖。当细菌达到一定数量时则会侵袭到蛋的内部，影响种蛋的孵化并将疾病传染给雏鸡，降低雏鸡的成活率。因此种蛋的消毒非常有必要。母乌鸡产蛋后的三十分钟内为种蛋消毒的最佳时机。
乌鸡种蛋的消毒方法有福尔马林熏蒸法、药液喷雾消毒法、药物浸泡消毒法、紫外线照射消毒法等。各养殖场应根据自己的实际情况选择使用，不管哪种方法都必须要保证消毒效果。
1、福尔马林熏蒸消毒法
每次收集完种蛋立即在鸡舍消毒室或孵化厂消毒室进行消毒。一般每立方米容积用42mL福尔马林加21g高锰酸钾，温度在20~24℃，相对湿度75%~80%的条件下，密闭熏蒸30min。在孵化机里进行第2次消毒，一般用福尔马林28mL高锰酸钾14g，熏蒸30min。如果只在入孵时进行1次消毒，一般每立方米用福尔马林14mL加高锰酸钾7g熏蒸1h。在孵化机内消毒时应避开24~96h胚龄的胚蛋。如种蛋从蛋库移出后，蛋壳上凝有水珠，应提高温度，待水珠蒸发后，再进行消毒，否则对胚胎不利。
2、药液喷雾消毒法
新洁尔灭原液浓度为5%，加水50倍配成0.1%的溶液，喷洒于种蛋的表面(注意上，下蛋面均要喷到)，经3~5min药液干后即可入孵。
3、药物浸泡消毒法
取高锰酸钾10g，加清洁水50L，在40℃的该溶液中浸泡2min，取出擦干入孵。注意浸泡时间和擦洗方法，以免影响孵化效果。
4、紫、外线照射消毒法
安装40W紫外线灯管，距离蛋面40cm，照射1min，翻过种蛋的背面再照射1次即可。
5、过氧化氢消、毒法
消毒种蛋时，每立方米用16%的过氧乙酸40~60mL,加高锰酸钾4~6g，熏蒸15min。但应注意，过氧乙酸遇热不稳定，浓度超过40%以上时，加热至50℃易引起爆炸，应在低温下保存;过氧乙酸腐蚀性很强，不要接触衣服、皮肤、消毒时用陶瓷盒或搪瓷盒;消毒时应现用现配，稀释液保存不超过3d。
6、碘液浸泡消毒法
10g碘片、15g碘化钾，放入1L水中使之溶解，然后再倒入9L洁水中，配成1:1000的碘液，将该碘液加热至43~45℃，放入种蛋，浸泡0.5~1min。一般浸泡10次后，可将浸泡时间延长至1.5min，或更换新的碘液。
乌鸡种蛋消毒的方法很多，不管采用哪种消毒方法都一定要消毒到位才能起到效果，提高孵化率及雏鸡的成活率。
