福田区位于深圳经济特区中部，是市人民政府所在地。该区于1990年1月4日建制，区人民政府于同年10月7日成立。区政府驻沙头街道。全区总面积78.8平方公里，行政区域东起红岭路与罗湖区相连，西至侨城东路与南山区相接，南临深圳河、深圳湾与香港新界相望，北与宝安区接壤。
罗湖区位于深圳经济特区中部，是深圳市开发较早的商业中心区。该区于1990年1月4日建制，区人民政府于同年9月21日成立。区政府驻黄贝街道。全区总面积78.36平方公里，行政区域东接盐田区，西至红岭路与福田区相连，南临深圳河与香港毗邻，北与龙岗区、宝安区接壤。
南山区位于深圳经济特区西部。该区于1990年1月4日建制，区人民政府于同年9月24日成立。区政府驻南头街道。全区总面积182平方公里（包括内伶仃岛和大铲岛），行政区域东至侨城东路与福田区相连，西扼珠江口与珠海市相邻，南至深圳湾和内伶仃岛与香港隔海相望，北背羊台山与宝安区接壤。
盐田区位于深圳经济特区东部。该区于1997年10月建制，区人民政府于1993年3月成立。区政府驻海山街道。全区总面积72.36平方公里，行政区域东起大鹏湾背仔角与龙岗区相连，西接罗湖区，南连香港新界，北靠龙岗区。
宝安区位于深圳市西北部。该区于1992年11月11日建制，区人民政府驻新安街道（宝安县城）。全区总面积733平方公里，行政区域东接龙岗区，西临伶仃洋与中山市相望，南连南山区、福田区和罗湖区，北靠东莞市。深圳宝安国际机场在该区辖区内。
龙岗区位于深圳市东部。该区于1992年11月11日建制，区人民政府驻龙城街道。全区总面积844.07平方公里，行政区域东南临大亚湾与惠州市相邻，西接宝安区，南连罗湖区、盐田区，隔大鹏湾与香港相望，东北靠惠州市、东莞市。大亚湾核电站在该区辖区内。
龙华区，地处广东省深圳市中北部，该区于2016年10月经国务院批复成立，区人民政府驻观湖街道。龙华区东临龙岗区，西接宝安区、南山区、光明新区，南连福田区，北至东莞市。
坪山区位于广东省深圳市东北部，该区于2016年10月经国务院批复成立，区人民政府驻坪山街道。包括坪山、坑梓两街道办事处和大工业区在内，总面积为168平方公里，是深圳市东部主要工业基地。新区东靠惠州大亚湾石化城，南连具有优美原生态的大鹏半岛，西邻世界最大的单体港——盐田港，北面是商贸发达、配套齐全的龙岗中心城，是深化深莞惠合作的重要战略节点。
2018年5月25日 ，广东省政府日前发布广东省人民政府关于设立深圳市光明区的通知。通知显示，国务院已同意设立深圳市光明区。这意味着，原光明新区变成光明区。这是一年多以来，深圳第3个新区从功能区转变为行政区。
大鹏新区原属龙岗区，是深圳市最年轻的一个功能新区，位于深圳东南部，三面环海，东临大亚湾，与惠州接壤，西抱大鹏湾，遥望香港新界。辖区面积607平方公里，其中陆域面积294.18平方公里，约占深圳市六分之一。下辖大鹏、南澳、葵涌三个办事处，25个居委会，总人口约18万。2011年12月30日“大鹏新区”揭牌成立。
深汕特别合作区（中文简称：深汕（特）区、深汕新区、英文简称：SSCZ），全称为广东省深汕特别合作区，是全国第一个特别合作区、拥有地级市管理权限，位于汕尾市由深圳市管辖。
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