1、最后的戚家军在万历年间因讨薪被军官诬陷“倡乱”而被明廷屠杀殆尽，生还者被遣返回乡了。
2、万历二十三年（1595年）打完朝鲜战争之后陷入了弹尽粮绝的境地。到了十月间，明廷已经拖欠他们的军饷很久了，这些远离家乡的军人一家老小的生活都陷入了困境之中。
终于，饥寒交迫的戚家军再也无法忍耐下去了，他们集合起来，跑到蓟州镇总兵府讨薪，要求按当初承诺的双饷标准发放拖欠的军饷，并且兑现平壤之战中先登城头的赏银。
3、而此时的蓟州总兵王保，早就看这些“南蛮子”不顺眼了，遂决定趁机以“倡乱”的借口对戚家军进行屠杀。据《明史王保传》记载，王保以发饷的名义诱骗戚家军到石门寨演武场集合，然后设下埋伏，对手无寸铁的戚家军进行了残酷的屠杀，当场杀死数百人。
事件发生以后，明廷不但没有追究王保滥杀有功将士的罪行，反而认为“南兵大逆有十”，王保杀得好，杀得对，以“平定兵变”之功得以加官进爵，封妻荫子。而戚家军呢？除了被杀的人，其余的人据《明神宗实录》记载是“余党尽驱南还”——全部遣散回浙江老家了。
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